Sau thất bại trên sân Anfieldl, HLV Ferguson tuyên bố: "Tôi đã hiểu tại sau các CLB thường rời nơi đây với những những lời phàn nàn khó nghe, tất cả là do các trọng tài".

Sau trận hòa với Aston Villa năm 2001, HLV Ferguson phàn nàn đáng ra thời gian bù giờ phải dài hơn: "4 phút bù giờ ư? Đúng là trò đùa. Nếu tính đúng ra thì phải là 14 phút".

HLV Ferguson bị cấm chỉ đạo hai trận và phải nộp phạt 10000 bảng do những lời chỉ trích nhắm vào trọng tài thứ tư Jeff Winter trong trận gặp Newcastle.

Paul Scholes phải nhận thẻ đỏ trong trận thua trước Everton năm 2005. Sau trận đấu vị chiến lược gia người Scotland không ngần ngại cho biết: "Chúng ta có một trọng tài quá yếu kém".

Trọng tài Herbern Fandel truất quyền thi đấu của Scholes trong trận thua 1-2 trước Roma vào năm 2007. Sau trận đấu HLV Ferguson tuyên bố: "Hãy coi lại đi, chúng tôi phải thi đấu với 10 người trên sân. Một kết quả tuyệt với đấy ông trọng tài".

Sau trận hòa 2-2 với Arsenal tại Emirates vào năm 2007, HLV Ferguson xỏ xiên trọng tài Howard Webb : "Ở thời điểm đó, ông ta là CĐV của Arsenal".

Bị cấm chỉ đạo hai trận và phải nộp phạt 5000 bảng do những lời xỏ xiên nhắm vào trọng tài Mark Clattenburg trong trận gặp Bolton

"Tôi có làm gì sai đầu, tôi chỉ nói cho Mark biết ông ta đã bắt tệ như thế nào trong hiệp một".

Chỉ trích trọng tài Martin Atkinson đã bênh vực Portsmouth trong trận đấu tại FA Cup năm trước.