Trong 2 ngày ở Huế, Nhà vua và Hoàng hậu đã ghé thăm Đại nội Huế, nghe nhã nhạc cung đình Huế. Tiếp đó, Nhà vua và Hoàng hậu
ghé thăm nhà lưu niệm chí sĩ yêu nước Phan Bội Châu và tiếp những người Nhật đang sinh sống, làm việc ở Huế.
Hai bên đường Lê Lợi gần khách sạn Nhà vua Nhật Bản nghỉ lại, hàng trăm người dân địa phương đứng chờ sẵn từ sáng để chào tạm biệt, với những lá quốc kỳ Việt Nam và Nhật Bản tượng trưng cho tình hữu nghị của 2 quốc gia.
Đúng 11h30, đoàn xe Nhật hoàng và Hoàng hậu cùng đoàn tùy tùng đã đến sân bay Phú Bài. Tại đây, nhiều người dân đã chờ sẵn để tiễn Nhà vua Nhật Bản.
Ông Nguyễn Ngọc Thiện, Bộ trưởng Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch; ông Nguyễn Văn Cao, Chủ tịch UBND tỉnh Thừa Thiên Huế cùng nhiều lãnh đạo ban ngành từ trung ương đến địa phương đã có mặt tại sân bay để chào tiễn Nhà vua cùng Hoàng hậu.
Trước khi lên chuyên cơ, Nhà vua và Hoàng hậu đã bắt tay chào hỏi và nói lời tạm biệt đến các vị lãnh đạo trung ương và địa phương cùng một số nhân viên đã phục vụ chuyến thăm của Nhật hoàng trong suốt gần một tuần qua.
Cảm kích trước sự đón tiếp và đưa tiễn nồng nhiệt từ Việt Nam, Nhà vua Akihito và Hoàng hậu Michiko đã rất vui mừng và cảm thấy hài lòng trong chuyến thăm Việt Nam lần này.
Đúng 12h15, chuyên cơ mang số hiệu 20-1102 của Nhà vua và Hoàng hậu Nhật Bản cất cánh sang thăm Thái Lan trước khi trở về Nhật Bản.
Sau ba ngày tại Hà Nội với hàng loạt sự kiện, Nhà vua Akihito và Hoàng hậu Michiko đã đặt chân tới cố đô Huế, nơi được cho có nhiều nét tương đồng về mặt văn hóa với Nhật Bản.
Nhà lưu niệm cụ Phan Bội Châu, nhà chí sĩ yêu nước của phong trào Đông Du, là điểm đến quan trọng trong lịch trình chuyến thăm cố đô Huế của Nhật hoàng và Hoàng hậu.
