Trong phiên họp báo Chính phủ thường kỳ tháng 2/2014, trả lời về việc thông tư 16 liệu có được ban hành trái luật và người ký thông tư này có cần thiết phải xin lỗi dân hay không, Thứ trưởng Bộ Xây dựng Nguyễn Trần Nam khẳng định thông tư này đúng luật. Ông Nam nói, văn bản này được ban hành đúng quy định, theo thẩm quyền, và phù hợp với tình hình kinh tế xã hội, theo thông lệ trong nước và quốc tế.
Cụ thể, Bộ Xây dựng được Chính phủ yêu cầu quy định cụ thể cách tính diện tích căn hộ, dựa trên các nội dung về phần diện tích thuộc sở hữu chung, riêng, kinh phí bảo trì đã được làm rõ trong nghị định 71/2010 (hướng dẫn thi hành luật Nhà ở 2005). Theo tinh thần này, Bộ Xây dựng đã đưa vào thông tư 16/2010 hai cách tính diện tích căn hộ mua bán để các bên tự thỏa thuận (tính theo thông thủy hoặc tính theo tim tường). Vì luật Nhà ở 2005 vẫn có hiệu lực thi hành nên thông tư 16 vẫn có căn cứ pháp lý và đúng thẩm quyền.
Ngoài ra, Thứ trưởng Nam cho biết, căn cứ vào tính thực tiễn và thông lệ mua bán nhà đất tại Việt Nam từ năm 1994 đến nay, việc tính diện tích nhà theo tim đường đã được người dân thực hiện từ lâu. Bộ chỉ quy định 2 cách tính để người dân lựa chọn, đảm bảo tính hợp pháp, hợp lý, "nên không có chuyện Bộ phải xin lỗi", ông Nam nhấn mạnh.
Phản bác ý kiến cho rằng việc ban hành thông tư 03/2014 của Bộ Xây dựng là để sửa sai thông tư 16 trước đó, ông Nam khẳng định rằng việc sửa đổi một điều trong thông tư 16 cũ không phải vì sai, mà vì quy định hiện không còn phù hợp với thực tiễn. "Thay vì trước đây hướng dẫn 2 cách tính diện tích sàn (áp dụng theo thông lệ ) thì thông tư 03 chốt lại một phương án bởi trong quá trình áp dụng, doanh nghiệp, người dân có nhiều cách thức hiểu, có thể sai và gây nhiều khó khăn cho việc áp dụng. Thông tư 03 đưa ra một cách thống nhất hơn, chứ 16 không sai".