Vào thời điểm trên, đoàn tàu SE7 lưu thông theo hướng Bắc - Nam do lái tàu Đặng Hữu Sơn điều khiển khi đến địa điểm trên thì gây tai nạn với Lâm Tấn Trọng (SN1997 ở thôn 1 xã Tiên Lộc, huyện Tiên Phước, Quảng Nam) và Nguyễn Văn Thức (SN 1996 ở thôn 3 xã Tiên Thọ, huyện Tiên Phước, Quảng Nam).
Vụ tai nạn làm Thức chết tại chỗ, còn Trọng chết trên đường đưa đi cấp cứu. Theo gia đình nạn nhân, Thức có biểu hiện tâm thần, thường bỏ nhà đi lang thang và hay lên đường ray xe lửa để ngủ.
Nhận tin báo, lực lượng Công an TP.Tam Kỳ đã có mặt kịp thời để tiến hành khám nghiệm hiện trường vụ tai nạn giao thông. Gia đình nạn nhân đã làm đơn xin nhận thi thể về quê mai táng.