Ngày 12/10/2019, toà soạn đăng bài phỏng vấn Tiến sĩ Tôn giáo học Dương Ngọc Dũng về vụ sư Thích Thanh Toàn với tựa đề "Đi tu mà có 300 tỷ là trái Luật Phật giáo, không biện luận được".
Sau khi nhận được phản hồi từ ban trị sự giáo hội Phật giáo một số tỉnh, thành về nội dung trả lời của Tiến sĩ Dương Ngọc Dũng, Báo Tri thức trực tuyến đã chủ động trao đổi với đại diện Trung ương Giáo hội Phật giáo Việt Nam và Tiến sĩ Dương Ngọc Dũng.
Nhận thấy một số nội dung trong bài viết chưa đạt chuẩn mực, gây tổn thương tình cảm tôn giáo của các bậc chân tu và các phật tử, ngày 4/11, toà soạn đã gỡ bài báo trên.
Báo Tri thức Trực tuyến chân thành cáo lỗi với Trung ương Giáo hội Phật giáo Việt Nam, cộng đồng phật tử và bạn đọc.
